Eesti Evangeelsel Luterlikul Kirikul on 165 kogudust, Eesti Evangeelsete Kristlaste ja Baptistide Koguduste Liidul on 84 kogudust, Eesti Apostlikul Õigeusu Kirikul on 59 kogudust, Moskva Patriarhaadi Eesti Õigeusu Kirikul on 32 kogudust, Eesti Kristlikul Nelipühi Kirikul on 28 kogudust, Eesti Metodisti Kirikul on 26 kogudust, Eesti Adventistide Koguduste Liidul on 19 kogudust, Eesti Vanausuliste Koguduste Liidul on 11 kogudust, Rooma-katoliku Kirikul Eestis on 8 kogudust, Eesti Evangeelsete ja Vabakoguduste Liidul on 5 kogudust, Eesti Karismaatilisel Episkopaalkirikul on 4 kogudust, Eesti Evangeeliumi Kristlaste ja Nelipühalaste Liidul on 3 kogudust.